| גִרְסָה | 2.1.2 |
|---|---|
| מוֹצִיא לָאוֹר | BioSolveIT |
| תאריך הוצאה | 2 במאי 2013 |
| תאריך הוסף | 2 במאי 2013 |
| דרישות Os | Windows 2003, Windows 2000, Windows Vista, Windows, Windows 7, Windows XP |
| דרישות | None |
| סה"כ הורדות | 25 |
| מחיר | Free |
תיאור
FlexS מנבא את הקונפורמציה והכיוון של אחד מהליגנדים ביחס לשני. ב-FlexS מניחים שה-Reference-ligand הוא קשיח, לפיכך, יש לתת אותו בקונפורמציה הדומה למצב הכבול. אלגוריתם הסופרפוזיציה ב-FlexS דורש התערבות ידנית מועטה בלבד. אתה יכול לשלב את הידע הזה בחישובים עם FlexS על ידי ביצוע שלבים בודדים באופן ידני. לפיכך, FlexS מיועד לעבודה אינטראקטיבית על זוגות ליגנדים וכן להקרנה וירטואלית מבוססת ליגנד. שני היישומים העיקריים של FlexS הם מיקום סופר ליגנד (למשל עבור CoMFA/QSAR) והקרנה וירטואלית. אם יש לך חלבון ומולקולה קטנה שנקשרה אליו (מה שנקרא reference-ligand) אך אין לך מבנה של החלבון, אתה יכול לקחת את מבנה ההתייחסות כטביעת אצבע שלילית של האתר הפעיל. FlexS קובע את הדמיון בין הבדיקה למבנה הייחוס על ידי יישורם. בהקרנה וירטואלית, יש לך רפרנס-ליגנד ומערכת של תרכובות ואתה מעוניין לתעדף את התרכובות לבדיקה ניסיונית.