| גִרְסָה | 7.3 |
|---|---|
| מוֹצִיא לָאוֹר | Scalable Computing Laboratory |
| תאריך הוצאה | 28 במאי 2009 |
| תאריך הוסף | 28 במאי 2009 |
| דרישות Os | Mac OS X 10.3.9/10.4 Intel/10.4 PPC/10.5 Intel/10.5 PPC |
| דרישות | None |
| סה"כ הורדות | 864 |
| הורדות בשבוע | 1 |
| מחיר | Free |
תיאור
MacMolPlt הוא כלי להדמיה של כימיה שניתן להשתמש בו כדי לבנות מולקולות עם בונה מודלים גרפיים משולב, ליצור קבצי קלט עבור תוכנית הכימיה החישובית GAMESS, ולאחר מכן להמחיש את התוצאות של ריצות כימיה חישובית. התכונות כוללות תצוגה תלת מימדית באיכות גבוהה, אנימציות של מצבים רגילים ורצפי תגובה ופלט למגוון פורמטים כולל תמונות באיכות גבוהה וסרטי QuickTime ו-Flash.
קלט באמצעות: פורמט קובץ MolPlt מחורר על ידי GAMESS על ידי הדבקת קואורדינטות קרטזיות מכל קובץ יומן GAMESS או גאוס כל קובץ GAMESS, יומן או קובץ irc Xmol בסגנון XYZ קובץ בפורמט MolDen קבצים בפורמט חלבון Data Bank (pdb) קובץ Chemical Markup Language (CML) קבצים בנייה גרפית עם עורך מולקולות אינטראקטיבי בנייה ידנית תוך שימוש בקואורדינטות פנימיות בסגנון קרטזי או Z-Matrix תצוגת תלת מימד של מבנה ומצב רגיל אנימציה של מצבים רגילים. סיבוב ותרגום תלת מימד בזמן אמת תחת שליטה בעכבר חישוב של כל פרמטר Z-matrix מדידה/הצגה חזותית מרחקים, זוויות ודיהדרלים. יצירה אוטומטית של נתיבים ליניארי תנועה קטנה (LLM) חישוב ותצוגה דו-ממדית ותלת-ממדית של: אורביטלים מולקולריים (AO's, MO's, או LMO's) הבדלי צפיפות אלקטרון כוללת פוטנציאלים מולקולריים אלקטרוסטטיים (MEPMaps) מחולל קבצי קלט בסיסי עבור GAMESS OpenGL גבוה עיבוד תלת מימדי איכותי תמיכה בסימטריה מולקולרית צור אטומים תלויי סימטריה קבע סימטריה אטומים ייחודיים קבע אוטומטית את רשימת קבוצות הנקודות הנתמכות עבור קבוצת קואורדינטות. סובב קואורדינטות לכיוון העיקרון הנכון הצג אופרטורים של סימטריה עבור קבוצות נקודות רבות פלט באיכות פרסום (צבע או שחור ולבן) באמצעות הדפסה ישירה או העתקה והדבקה ביישום אחר. פלט במגוון צורות כולל Windows Bitmap, JPEG, PNG, CML, XMol XYZ, MDL molfile, POV-Ray, Flash Movies וסרטי QuickTime.
