| גִרְסָה | 4.5 |
|---|---|
| מוֹצִיא לָאוֹר | Bioinformatics Solutions |
| תאריך הוצאה | 10 במאי 2010 |
| תאריך הוסף | 16 ביולי 2010 |
| דרישות Os | Windows XP/Vista/7 |
| דרישות | None |
| סה"כ הורדות | 9,464 |
| הורדות בשבוע | 9 |
| מחיר | Free |
תיאור
RAPTOR היא תוכנה חדשנית המיועדת לחיזוי מדויק של מבנה החלבון. הוא משלב כלי ניתוח מתקדמים בפתרון תוכנה משולב אחד ומספק שלוש שיטות השחלה שונות. גישת האופטימיזציה לתכנות שלמים ייחודיים של RAPTOR יעילה ביותר למציאת תבניות מבנה של יעדים עם הומולוגיה ברצף נמוך ומסוגלת ליצור מודלים באיכות גבוהה. הממשק קל לשימוש וערכי E קלים להבנה הם אידיאליים למתחילים ומומחים. מעל הכל, התצוגה האינטואיטיבית של הפלט מאפשרת למשתמשים להבין את התוצאות במבט אחד. בהינתן רצף חלבוני יעד, אם יש חלבון הומולוגי עם מבנה תלת ממדי ידוע, ניתן למצוא אותו באמצעות כלי חיפוש רצף כמו PSI-BLAST, המסופקים גם ב- RAPTOR. מבנה המטרה נבנה לאחר מכן מהמבנה הידוע; עם זאת, כאשר ההומולוגיה של הרצף אינה משמעותית, כלומר פחות מ -25%, PSI-BLAST אינו יכול להגיע למכה בטוחה. בניגוד ל- PSI-BLAST, שפשוט מבצע חיפוש רצף, השחלת חלבון, זיהוי קיפול, עושה שימוש הן בהומולוגיה והן במידע על מבנה. הוא סורק את רצף החלבונים במבנה לא ידוע מול בסיס נתונים של מבנים ידועים. על ידי שימוש בפונקציית ניקוד וביצוע ניתוח תאימות בין מבנים תלת מימדיים לרצפי חלבונים ליניאריים, זוהה התבנית המבנית הטובה ביותר שממנה ניתן לבנות את מבנה הרצף. כתוצאה מכך, השחלת חלבונים נותנת תחזית מעולה מאשר דוגמנות הומולוגיה כשיש הומולוגיה של רצף שולי.
